Estudios y caracterizacion de genes expresados diferencialmente en Fragaria chiloensis en respuesta a infeccion por Botrytis cinerea

Abstract

Esta memoria trata sobre el análisis de dos secuencias de genes de Fragaria chiloensis obtenidas por hibridación substractiva, generada a partir de plantas sometidas a infección con Botrytis cinerea. Estas secuencias presentan clara homología con genes AAT de Fragaria x ananassa luego de realizar un estudio de BLAST. A partir de las secuencias obtenidas, se diseñaron partidores específicos para así realizar, en un trabajo posterior, un RACE (Rapad Amplification of cDNA Ends) y así extender el largo de los fragmentos. Para poder obtener partidores específicos para ambas secuencias, se realizó una comparación con otras secuencias AAT de F. chiloensis, previa limpieza de éstas por análisis de cromatogramas. Las secuencias AAT fueron traducidas y comparadas con secuencias AAT aminoacidicas de frutos climatéricos y no climatéricos. Se vio que la identidad es alta aún cuando se comparan AATs entre diferentes especies y además que existen dominios idénticos entre AATs de frutos climatéricos y no climatéricos. Además, se prepararon todas las muestras necesarias para la continuación del estudio, es decir, se realizó extracción de material genético (RNA) de F. chiloensis y F. ananassa, con la consecuente síntesis de cDNA a concentración fija.